康有为接着指出，所谓变法，首先要把制度法律完全改订，否则只是“变事”，而不是“变法”。他请求光绪皇帝统筹全局，先设立“制度局”，改变制度法律。康有力又指出，现在朝中的大臣，大都老朽守旧，不懂世界大势，又不学习，要靠他们来变法，是没有希望的，所以一定要提拔有真才实学的年轻官员和知识分子，来办理新政。至于原来的老臣，可以采取养起来的办法，只要他们不干扰新政，就保持他们原来享受的待遇。

光绪皇帝对康有为的意见都很欣赏。但是就在谈话过程中，他还怕慈禧太后派人偷听，并且叹息慈禧太后实际上掌握着国家大权，干扰太大。康有为希望他把现在能做的事情先做起来再说，而且回答了光绪皇帝对许多具体问题的提问。经过这次召见，光绪皇帝打算重用康有为，可是却遭到了保守派大臣荣禄、刚毅等人的反对，结果只给了他一个在总理衙门上行走的职位，准许他直接向皇帝上书奏事。

康有为抓住了这个特殊待遇，在变法维新的一百来天中，几乎每天都有专门的奏折给皇帝，从政治、经济、军事、教育等各方面，提出了一系列除旧布新的建议。而光绪皇帝对他的建议也十分重视，采纳了很大部份，在这一段时间中，光绪皇帝几乎每天都有关于新政的政令颁布。

但是，变法维新从一开始就受到了慈禧太后为首的保守顽固派的反对。

慈禧太后最初能允许光绪皇帝实行新政和变法，是有原因的。一是由于《马关条约》的丧权辱国，激起了全国人民的极大愤怒，她不得不暂时退往幕后；二是由于她还没抓住光绪皇帝的把柄，没有做好发动政变的充分准备；三是主张变法的改良派同英、美传教士有联系，她怕得罪外国人。但是，慈禧太后也决没有放弃干扰破坏的努力。在光绪皇帝宣布变法后的第四天，她就借故罢免了光绪皇帝的老师翁同龢。翁同龢是主张变法的中坚人物，光绪皇帝接到慈禧太后发来的命令，顿时脸色大变，浑身颤抖，好像折断了一条胳膊。与此同时，慈禧太后又任命她的心腹亲信荣禄兼任直隶（河北省）总督，统率董福祥、聂士成、袁世凯三支军队，实际上掌握了北京及其周围的军事大权，为他们后来发动政变打下了基础。

慈禧太后一派的保守派大臣，不断向康有为等改良派发动攻击。虽然由于光绪皇帝的保护，康有为暂时没有遭到罢免；但光绪皇帝也深深感到变法难以推行。

而各省的大臣，多半是慈禧太后扶植起来的，对变法维新都抱消极态度，或者借词推托，或者阳奉阴违，不干实事。尽管光绪皇帝三令五申，他们自然不放在眼里。朝中的顽固派大臣，公然同光绪皇帝争执吵闹，并且动不动就说：“希望皇上去请示太后！”光绪皇帝虽然不满，也无可奈何。在变法期间，他曾十二次到颐和园去拜见慈禧太后，请示重大问题：对于顽固派的大臣，光绪皇帝也不敢放手处罚罢免，时时要对他们做出让步。

到了这年8 月下旬，慈禧太后认为发动政变的时机已经成熟，便开始一步步行动起来。8 月23 日，光绪皇帝到颐和园去拜见慈禧太后，慈禧太后就通知他，计划在9 月份举行阅兵活动的日程。光绪皇帝就已预感到大事不妙了。9 月4 日，光绪皇帝又同顽固派大臣发生了一次激烈冲突。事情的起因是礼部的一个主事王照，写了一份奏折，请光绪皇帝游历日本和西洋各国，并请建立商部和教部。王照的官职小，没有资格直接向皇帝上书，必须由礼部负责人代转。可是礼部尚书怀塔布、许应骙是保守派，不肯代递，认为皇帝出国考察是不可行的。王照坚持要求代转，怀塔布、许应骙仍然不肯。王照便又写奏折揭发怀塔布、许应婴的行为，请皇上处分他们，并扬言二人如再不代他转奏，他就到都察院去控告他们。怀塔布、许应骙只好代王照转了奏折，但同时也写了奏折，攻击王照。哪知光绪皇帝不但表扬提升了王照，而且罢了怀塔布、许应骙等人的官。第二天，光绪皇帝又提拔了杨锐、刘光第、林旭、谭嗣同等人。这是光绪皇帝对慈禧太后一伙保守派的强烈反击。

怀塔布等人被罢官后，纷纷到天津去找荣禄，阴谋筹划军事政变，推翻新政。