方舟制成后，诺亚及其家人和一些动物乘上了船。不久，天上下起了大雨。大雨持续下了40天，地上的一切都被水冲走了。水势不断上涨，洪水逐渐淹没了高山的山顶，方舟在一片汪洋之中漂到了阿拉拉特山顶。再后来，洪水慢慢消退，诺亚方舟停留在阿拉拉特山。他首先放出鸽子，看洪水退后的世界怎样了，第一次，鸽子飞回来了，因为洪水还没有消退，鸽子无处停留；第二次，鸽子飞回来时，嘴里含着橄榄枝嫩牙，表明洪水已退，树上长出了新芽；第三次把鸽子放出去后，鸽子再也没有回来。诺亚一家及所带动物便从方舟出来，重新改造洪灾劫后的世界，后人为纪念劫后新生，便把鸽子和橄榄枝视为和平的标志，而诺亚所造的那艘方舟，便永远地停留在了5000多米的阿拉拉特山上。

“诺亚方舟”的故事，流传至今，已足足6000年了。几个世纪以来，人们都在为有无诺亚方舟争论不休，其实，有无诺亚方舟倒并不重要，问题在于，如果这一显然带有神话色彩的传说是确有其事的话，那么，我们就必须用认真的态度来看待《圣经》中的每一个传说故事了。

现代科学证明，诺亚方舟的故事发生的时期是第四纪全新世多雨的大西洋期，可能产生巨大洪水。

最早寻找诺亚方舟的是一些虔诚的基督教徒，但没有结果。后来，一些探险家也加入了这一行列，1792年、1850年、1876年，探险家们屡次登上阿拉拉特山顶，仍然一无所获。

取得突破性进展是在1883年，当时，一次大地震使阿拉拉特山脉的一个地段开裂了，开裂处露出了一条船。当时，有个赴阿拉拉特山区考察和评估地震灾情的委员会，委员会的所有成员都亲眼看到过那条大船，船身有12～15米高，因为木船有一大部分还嵌在冰川里，无法估计它的长度。

这个消息震惊了全世界。

1916年，第一次世界大战期间，俄国飞行员罗斯克维斯基在执行完侦察任务之后，沿着土耳其与伊朗边境飞回基地，当飞越阿拉拉特山上空时，他蓦然发现山顶上有一团青蓝色的奇怪东西，极大的好奇心促使他急忙把飞机掉过头来细看，他惊讶地看到山上有一艘很大的船体，船的一侧还有门，其中一扇门已毁坏。他拍下了照片，回去后，把这件事报告了俄国政府，政府马上派出两个连的兵力去寻找方舟，1个月后，他们找到了，并且进行了全面测量，拍摄了大量照片。方舟里有几百个房间，有用交叉的木块做成的大栅栏，这些房子前面还有一排排铁栓..第二次世界大战结束后，热心探索诺亚方舟的人越来越多。前苏联军官马斯科莱茵少校派出的一架飞机，也在阿拉拉特山上发现了一只巨大的木船。船只的一半已没入一座冰河中，它的长度大约120米，这与《圣经》记载的长度125米基本吻合。

40年代，一位土耳其飞行员拍到了一张阿拉拉特山上诺亚方舟的航空照片，由美国照相测量专家蒙登贝格经过放大处理，测量船长度为150米，宽50米。

法国探险家费尔南纳瓦拉曾于1952年、1955年和1969年三次到阿拉拉特山探险。1955年7月5日，他和他的12岁的儿子拉斐尔在一条山缝的底部，找到了一块方形的经过加工的木料。把这块木料送到美国纽约高级化验室用C14测定年代。经鉴定，这块木料已有5000～6000年的历史，即它是大约公元前4000年时被砍下并加工过的一块木料，而根据传说，公元前4000年正是诺亚建造方舟的那个年代。