28 日清晨，天皇召见了侍从武官长本庄大将和陆相川岛义之，劈头就问：“自从戒严以来，陆军为什么迟迟按兵不动，为什么不迅速地解决事端！” 裕仁天皇动怒了，他感觉到他的部下和政府官员果然在欺骗他，并一再向他谎报军情。

川岛陆相赶紧解释：“天皇息怒。敕令已于早晨向叛军发出，命令他们迅速撤离所占地区，回到各部队去。否则，陆军部将采取最严厉的制裁。”

“请记住，今天12 点之前，必须把所有的工作都做好，让每一个叛乱分子都看到敕令，并把他们的态度告诉朕。你们如果怠慢的话，那么，朕就亲自率领近卫师团去进攻叛军。难道你们以为朕就那么无能，听任你们的摆布吗？”裕仁天皇说罢拂袖而去。

这一来，没人敢怠慢了。遵照天皇的旨意，第49 、第57 联队已作好讨伐的准备，从外地调来东京。日本联合舰队也奉命开进东京湾。与陆军相比，海军要积极得多，海军官兵们恨不得立刻向叛军开火，为三名被害的海军老前辈——斋藤、铃木和冈田报仇雪恨。他们把军舰上所有的炮口对准了国会议事堂和首相官邸。

此时此刻，东京城充满了火药味，形势越来越严峻。

荒木、真崎大将作了最后一次努力，他们到戒严司令部去交涉，希望暂缓使用武力，但遭到断然拒绝。他们得到的回答是，如果叛军违抗命令的话，负责讨伐的香椎浩平中将将最迟于下午一点下令攻击。

至此，皇道派将领只得重新退到幕后，不再露面。这犹如一股突然改变方向的寒风，使得叛军士官感到震惊和愤怒。

29 日早晨，镇压叛军的坦克挂着劝告归顺的标语来回开动，飞机撒出大量传单，高音喇叭一遍又一遍地播送“告士兵书”，空中悬起了挂在气球上的标语：“不要反抗军旗。”在强大的舆论和军事压力下，叛军中开始人心涣散。中桥队首先吹号向皇宫行致敬礼。随后清原队、坂井队、野中队..一个接一个地归顺了。下午1 时，安藤辉三也投降了，他开枪自杀未遂，被部下阻止。

这时，山下奉文少将准备了十八口棺材，放在陆相官邸的大门口。他命令归顺的军官们都到官邸里来，问他们：“你们今后怎么办？”他叫他们愿意剖腹自决的站到右边，坚持“昭和维新”的站到左边。军官们受野中大尉、栗原中尉的劝说，都选择了法庭斗争的道路，没有一个自决。

这场历时84 小时的骚乱就这样平息了。然而，这些参与叛乱的军官们并没有逃脱死亡的厄运。四天以后，河野寿大尉剖腹自杀。7 月12 日上午，香田清真、安藤辉三、村中孝次、高桥太郎等十三名军官和包括北一辉在内的四名文官，都被绑在东京代代木卫戍监狱一角的刑柱上，蒙住眼睛，前额画了标靶，枪击处决。

令人吃惊的是，冈田首相并没有死。那天晚上，叛军杀死的是冈田的妹夫松尾传藏。因为两人长得十分相象，叛军没有识别出来。后来借着办丧事的机会，冈田在福田秘书长和小坂曹长的帮助下，化妆成吊唁的人，竟安全逃脱了。

2 月28 日晚6 点半，正当陆海军部队调集完毕，一切准备就绪时，冈田首相进入皇宫，求见裕仁天皇。天皇又惊又喜，立即召见他，并鼓励他继续干下去。