第二天，努尔哈赤重新调配了兵力，选派了一大批身高体壮的士兵，披上铁甲，顶着盾牌，分十几路同时围攻宁远城。后金兵远远望见城上并无动静，心中暗自高兴，误以为明军可能已弃城逃跑，一个个大着胆子往前冲。

突然间，城上炮声震天，烈焰翻腾，袁崇焕下令开炮了。金兵见状不妙，慌忙逃跑。怒尔哈赤大怒，喝令不准后退。可是，兵败如山倒，谁也不听他的。

他气得拔刀连砍了几个，仍然遏止不住。袁崇焕在高处看得分明，忙挥动令箭，指挥炮手集中炮火向后金太祖的坐骑轰击，终于击中了后金太祖的战马。

战马一声惊叫，把他掀翻在地，孙哈兔也在乱军之中中弹身亡。皇太极和诸将慌忙将努尔哈赤扶上战马，速速向后撤退。袁崇焕急令部将守城，自己率领明军乘胜追击。一气追赶三十余里，歼灭后金军一万余人。努尔哈赤带着残兵败将逃了许久才停下来，他仰天叹道：“我二十五岁起兵，战无不胜，攻无不克，今至垂暮之年，竟遭此惨败，真气死我了！”

宁远保卫战胜利的捷报传到朝廷，朝廷上下无不欣喜若狂，大家举杯庆贺。熹宗皇帝下旨将袁崇焕升为右佥都御史。

再说努尔哈赤自兵败后，心情郁闷，便卧病不起，不久又背患毒疽而亡。

他死后，他的子孙们又共同拥立第八子皇太极即了位，改元天聪。为继承父志，他重振旗鼓继续向辽河以西推进。

后金兵一路上势如破竹，直抵锦州，锦州守将赵率教一面急令做战前准备，一面遣人向宁远告急。次日，忽有明军二千余人，从大凌河逃来，大呼“决开城门！”赵率教心想：大凌河并无战事，哪来逃兵？随即登城仔细观察。心中立刻明白，喝道：“临阵脱逃，有何面目入城见我！”城下士兵哗噪不已。赵率教拈弓搭箭，射到头目一人。原来，金兵混在被俘的明军里，想骗开城门．被赵率教识破。赵率教心想：金兵诡计虽未得逞，明日必来猛力攻城。怎么办？踌躇良久，他终于想出一条计谋，连夜修好文书，派人送往金营。皇太极阅毕说道：“既然明军求和，我当保证其安全。”可是，一连三日，明军却无动静。皇太极猛然省语，知道中了赵率教的缓兵之计，他连夜集合三军，直扑锦州城，赵率教听得远处的号角声，料是后金兵攻城，忙指挥四面防守。后金兵分两路来到锦州城下，他们抬着云梯，持着盾碑，轮番攻城。赵率教坚守不出。皇太极无法破城，便将两支人马合为一处，集中猛攻西侧城楼。赵率教奋力抵抗，炮火矢石如暴雨般向后金兵打来。第三天天色微明，敌兵后面忽然不战自乱。原来，袁崇焕得到锦州告急文书后，便派祖大寿、何可刚等将率精兵四千，轻骑一千，星夜赶来援救锦州。赵率教急令打开城门，率领明军旋风般向金兵卷去。金兵前后受敌，伤亡惨重，皇太极只好率众突围。明军乘胜追击十余里才收兵回城。当天，皇太极逃离锦州二十里扎下营帐。左右向他献计道：“如今袁崇焕已派兵援救锦州城，宁远必然空虚，主上何不去盛京调来兵马，一举攻占宁远？”皇太极觉得有理，星夜命人赶往沈阳..

几天后，沈阳兵马赶到，与原有的兵马合为一处。皇太极大喜，决定与三大贝勒率三千轻骑先行，大队人马随后接应。他乘夜间安静，绕过锦州，避开援军，经过一昼夜急行军，于第二天拂晓抵达宁远城北岗。皇太极一看宁远城上旌旗不整，刁斗无声，疑道：“这是袁蛮子驻守的城池，难道没有防备么？此中必有诡计。”原来袁崇焕派出援军后，便命人前往打探。这天，探子来报，后金兵前来偷袭宁远。这些早已在袁崇焕的预料之中，便下令偃旗息鼓，以引诱金兵攻城；自己则率两军埋伏左右。与此同时，袁崇焕又令飞骑前往锦州，速调回援锦兵马。

这天，皇太极见西北来了一彪人马，打着袁字旗号，急令金兵迎击。战不多时，明军故意在后败退，皇太极驱兵追赶，将到城下，忽听一声炮响，袁崇焕领兵从右侧杀了出来。皇太极只好分兵抵抗。明军越杀越勇，后金兵两头受困，渐渐支持不住。猛然间，袁崇焕带领诸将冲入中军，万弩齐发。